Бурная вторая половина 80-х гг. ХХ века. Преобразования в обществе затронули и сферу образования. В республике создаются учебные заведения нового типа лицеи и гимназии. Сначала их было немного. Одним из первых стал Брестский лицей. Общеобразовательный лицей мыслился как учебно-воспитательное заведения системы общего среднего образования, которое обеспечивает получение общего среднего образования на повышенном уровне с учётом способностей интересов и наклонностей учащихся в сочетании с профильной подготовкой по направлениям и специальностям высшей школы. Главная цель лицея определялась как «создание благоприятных условий для формирования высококультурной и широкообразованной личности, способной к творческой и исследовательской деятельности». Лицей открывался в соответствии с Решением Исполнительного Комитета Московского районного Совета народных депутатов г. Бреста от 20 июня 1990 года.
Осенью 1990 года в микрорайоне Восток-5 появилось новое здание. Директором лицея была назначена Семёнова Светлана Николаевна. К 1-му сентября 1990 года здание лицея было не готово принять лицеистов и их учителей. Временно занятия проходили в аудиториях Брестского инженерно-строительного института. После уроков все отправлялись в лицей. Убирали строительный мусор, клеили обои, собирали мебель. Благодаря общим усилиям лицей принял своих питомцев уже 10 октября. Первый состав преподавателей физико-математического профиля: Яцкевич С.А., Панова И.В., Ласский Р.А., Гвилава В.А., Соков К.Д., Карамзин В.К., Слесарчук В.В., Дуванова В.С., Семенчук В.С.
В 1990-1991 учебном году группа 41 М была единственным выпускным классом. Классный руководитель В.М. Булава, учитель русского языка и литературы. Первые 25 выпускников, порадовали лицей своими успехами: 6 золотых и 10 серебряных медалей.
1992 год – первый большой выпуск лицея: 10 выпускных классов, 192 выпускника, Поработали на славу: 13 золотых медалей, 57 серебряных.
1994 год был этапным. Государственная инспекция учебных заведений Министерства образования Республики Беларусь аттестовала Брестский лицей оценкой «отлично». Столь высокая оценка стала мощным стимулом для дальнейшего движения вперёд, но уже на более высоком уровне. Высокопрофессиональная работа коллектива обращала на себя внимание. В сентябре 1995 г. лицей получил грант за активное участие в международной Соросовской научно-образовательной программе. В июле 1997 г. в связи с празднованием Дня Республики коллективу лицея был вручен личный приветственный адрес от Президента Республики Беларусь А.Г. Лукашенко.
90% учителей имеют высшую и первую квалификационные категории, 9 удостоены звания «Отличник образования», 2 – «Заслуженный учитель Республики Беларусь». Учителя лицея награждены премиями Брестского Облисполкома, Дипломами и премиями специального фонда президента Республики Беларусь по социальной поддержке одарённых учащихся и студентов за личный вклад в развитие способностей талантливой молодёжи.
Воспитанники лицея являются стипендиатами брестского Облисполкома и специального фонда Президента Республики Беларусь по социальной поддержке одарённых учащихся и студентов.
С 1996 года в лицее впервые проводится конкурс «Лицеист года». Участники конкурса- лицеисты, занявшие в рейтинге Интеллектуального марафона первые места. Конкурс – это своеобразное шоу, где учебные группы представляют своих кандидатов на звание «Лицеист года».
С 1990 года 19 октября объявлен Международным днем лицеев и гимназий. В этот день первые учащиеся Брестского лицея собрались у костра и поклялись ежегодно отмечать в этот день главный лицейский праздник. Отныне этот день символизирует братство лицеистов разных поколений, их стремление к образованности и высоким идеалам.
Традиции – часть духовной жизни человеческих сообществ. В их основе ценностные ориентиры, определяющие идеалы, деятельность, отношение к другим людям. Традиции придают устойчивость любому коллективу. В них отражена история. Поэтому в Брестском лицее традиции – это святое. Специфика лицея такова, что поколения его питомцев сменяются быстро. И тем не менее, здесь сумели создать свои традиции. И педагоги, и учащиеся относят к ним всё, что прижилось в коллективе, приносит пользу, интересно всем и потому сохраняется на протяжении многих лет. Главная традиция лицея – ежегодные празднования 19 октября Международного Дня лицеев. Этот праздник собирает вместе лицеистов разных поколений. В это день двери лицея, как и его душа, открыты для всех. Сценарий праздника традиционен и повторяется из года в год: трогательный Пролог, замечательный спектакль «На 59’Северной широты», посвящение в лицеисты новичков, обязательный заключительный бал.
В лицее существует культ великого поэта. Лицейская пушкиниана – это День лицея, День памяти Пушкина, поездки лицеистов по пушкинским местам, театральные постановки по мотивам произведений Пушкина и о жизни и творчестве поэта. Лицей был для Пушкина идеальным царством дружбы. «Друзья мои, прекрасен наш союз!». Эти пушкинские слова стали девизом Брестского лицея. Вдохновительницы и хранительницы пушкинских традиций в лицее Лариса Павловна Визгульб и Елена Фёдоровна Поленова .
Традиционны в лицее клубы «Что? Где? Когда?», Леди, Джентльменов, «Дебаты», КВН, театр «Образ», музыкальные коллективы, Неделя благодарения, туристические слёты, праздники, искрометные капустники. Традиционны стиль взаимоотношений между членами лицейского коллектива, дух дружбы и взаимопомощи. Хранителями лицейских традиций являются учителя. Они воспитывают в лицеистах уважительное и трепетное отношение ко всему, что было создано предыдущими поколениями. С 1998 года существуют дебаты. Лицейский клуб «Дебаты» Оксфордского типа - единственный в городе Бресте.
В 2000 году в лицее стала издаваться своя газета. Первый номер газеты «Lyceum» вышел к 10-летию лицея – 19 октября 2000 года.
С 2008 года в лицее ежегодно проводится конкурс «Семья года».
Днём рождения Научного лицейского общества «Парадокс» стал день 12 апреля 1994 года, когда состоялась первая общелицейская научно-практическая конференция «Одиссея разума», но первые конференции лицеистов-исследователей проводились ещё в 1992-1993 гг. В деятельности Научного Лицейского Общества «Парадокс» традиционно принимают участие 30-35% лицеистов.
Сегодня лицей - современное учебное заведение, осуществляющее обучение по четырём направлениям: физико-математическое, филологическое, химико-биологическое и обществоведческое. Известен в городе высоким качеством образования, уникальной авторской системой воспитания и психологического сопровождения учащихся, бережным отношением к пушкинским традициям. Является крупнейшим среди общеобразовательных учреждений города научно-методическим и культурным центром.
В 2010 году ГУО «Лицей №1 имени А.С. Пушкина г.Бреста» стал победителем среди организаций науки и образования Брестской области за достигнутые высокие показатели в социально-экономическом развитии по итогам работы за 2009 год Занесен на областную доску почёта.